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研究所面向世界農(nóng)業(yè)科技前沿、面向國家重大需求、面向現(xiàn)代農(nóng)業(yè)建設(shè)主戰(zhàn)場，圍繞“優(yōu)質(zhì)、安全、簡約、多樣、高效”的科技主攻方向,以種質(zhì)資源為基礎(chǔ)，以品種培育為核心，以栽培植保為支撐，以貯藏加工為拓展，以質(zhì)量檢測、風(fēng)險評估和科技信息為保障，開展應(yīng)用和應(yīng)用基礎(chǔ)研究，著力解決我國果樹瓜類產(chǎn)業(yè)發(fā)展中基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性、全局性、關(guān)鍵性、前瞻性重大科技問題，為保障國家食物安全、食品安全、生態(tài)安全、人民健康、農(nóng)民增收和可持續(xù)發(fā)展，推進(jìn)美麗中國、健康中國建設(shè)和農(nóng)業(yè)供給側(cè)結(jié)構(gòu)性改革，振興鄉(xiāng)村提供強(qiáng)有力的科技支撐，滿足人民日益增長的美好生活需要和優(yōu)美生態(tài)環(huán)境需要。

研究所經(jīng)過近60年的發(fā)展，形成了涵蓋種質(zhì)資源、遺傳育種、栽培生理、植物保護(hù)、貯藏加工、質(zhì)量檢測、風(fēng)險評估、科技信息、示范推廣等學(xué)科體系，創(chuàng)建了種類齊全、學(xué)科完整、特色鮮明、優(yōu)勢明顯的研究體系。

研究所堅持“以人為本、人才興所”的方針，大力加強(qiáng)人才隊伍建設(shè)，培養(yǎng)和匯聚了一批國內(nèi)外一流的領(lǐng)域科學(xué)家。全所共有600多人，在職職工202人。其中高級職稱80人，博士31人、碩士83人。中原學(xué)者1人，國家和省部級有突出貢獻(xiàn)中青年專家6人，享受國務(wù)院政府特殊津貼專家11人，國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位專家10人，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程創(chuàng)新團(tuán)隊10個，河南省大宗水果產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席1人。擁有果樹學(xué)、蔬菜學(xué)、植物病理學(xué)、農(nóng)業(yè)昆蟲與害蟲防治、農(nóng)產(chǎn)品加工與貯藏工程等博士和碩士培養(yǎng)點(diǎn)。

研究所擁有6個處室和10個研究中心，現(xiàn)有國家葡萄桃種質(zhì)資源圃、國家西瓜甜瓜中期庫、國家農(nóng)作物種質(zhì)資源平臺瓜果子平臺、國家瓜果改良中心、國家獼猴桃科技創(chuàng)新聯(lián)盟、農(nóng)業(yè)部果樹育種技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)部果品及苗木質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心、河南省果樹瓜類生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、國家外專局引智示范推廣基地、中國-新西蘭果樹科學(xué)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室、中國-西班牙果樹科學(xué)與技術(shù)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室、中國-保加利亞果樹生物學(xué)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室等科技平臺，在全國布局建設(shè)10個試驗(yàn)站和100個成果示范基地。主辦《果樹學(xué)報》、《中國瓜菜》和《果農(nóng)之友》三份科技期刊。研究所是中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院文明單位和河南省文明單位。

研究所共取得各類科研成果207項(xiàng)，其中10項(xiàng)成果獲國家級科技獎勵，95項(xiàng)成果獲得省部級獎勵，培育并通過省級以上審定的果樹瓜類新品種209個，其中國審（鑒）品種38個，形成了一批具有自主知識產(chǎn)權(quán)的新基因、新種質(zhì)、新品種、新技術(shù)和新產(chǎn)品，產(chǎn)生了巨大的社會經(jīng)濟(jì)效益。