影響污染率的外因有空氣污染，接觸污染。影響污染率的內因有菌種抗雜能力，物料的抗雜能力。
空氣中漂浮有大量雜菌，減少空氣中雜菌量就可以降低空氣污染的機會。注意以下問題：
1、環(huán)境和地面：周圍環(huán)境中不要有污物、垃圾各種散料，周邊環(huán)境一定要清潔，上風口一定是干凈的無任何散料和臟污物質。而且上風口的地面一定要加消毒劑噴濕，防止粉塵漂浮。地面一定要消毒，并且保持潮濕，防止揚起灰塵。接種前空氣消毒，減少空氣中雜菌的濃度。過去消毒采用含氯消毒劑，但這些消毒劑刺激呼吸道，造成工人極度不適，甚至引起哮喘，建議使用臭氧機，臭氧機產生的臭氧有很好的消毒效果，而且臭氧很容易分解，不會對環(huán)境和人體產生不利影響。
2、個人衛(wèi)生：服裝衣物鞋帽一定要洗過并經過消毒，最好再套上無菌衣。沒有洗過的衣物纖維里會吸附大量的塵埃和微生物，工作時抖動會有大量的塵埃漂浮的周圍環(huán)境中，穿不干凈的衣服接種會讓接種口周圍的微生物濃度提高幾十或幾百倍。接種人員的著裝一定要嚴格保持干凈衛(wèi)生。
3、防止接觸污染：接觸污是指通過工具設備、手和接種口直接接觸造成的污染。避免接觸污染，必須把所有的器具徹底消毒，手和菌袋接種位置用75%酒精擦干凈，而且接種器具和手在工作時隨時有可能碰到污染，因此要接一部分菌棒后重新消毒，以防止造成連續(xù)的污染。
4、選擇抗雜菌能力強的菌種：一是遺傳特性上抗雜菌能力強，二是菌種活力旺盛。菌種能夠快速萌發(fā)可以抑制雜菌生長。另外菌種要堵滿菌種眼不要有原料暴露。
5、 合適的接種溫度：菌棒冷卻到25度以下才可以接種。溫度過高不利于食用菌菌絲發(fā)育，同時雜菌會滋生太快。
6、接種速度要快：接種速度越快，空氣中的雜菌落在接種口表面的機會越少。
7、物料的抗雜能力也非常關鍵：開放接種難免有雜菌落在接種眼上。如果物料本身不利于雜菌生長而利于食用菌生長就會降低雜菌生長的速度，利于食用菌形成競爭性優(yōu)勢。我們開發(fā)的減免麩皮栽培技術的目的之一就是為了減少污染，因為麩皮營養(yǎng)利于利用，所有雜菌都可以在麩皮上快速生長，麩皮是污染的重要原因。利用富營養(yǎng)增菇酶減免麩皮，利于食用菌生長而不利于雜菌生長，由此可以大幅度減少雜菌的污染。
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