黑木耳菌種制作的各個(gè)環(huán)節(jié)都應(yīng)按照操作流程規(guī)范進(jìn)行：
一、菌種配料
配方：木屑81%、麥麩15%、黃豆粉或豆餅粉2%、石膏1%、紅糖1%。
先將81%鋸末稱好，再將15%麥麩或稻糠，2%的黃豆粉或豆餅粉，1%石膏干拌拌均，再把1%紅糖溶解在5升水中，將溶解的紅糖水與麥麩，黃豆粉，石膏先干拌的混合物拌均，拌均后悶堆30分鐘后，再與81%鋸末摻和在一起干拌拌均，拌勻后加水翻3～4遍攪拌均勻，使含水量達(dá)～65%，用測水儀的指針扎入鋸末，看表盤指針讀數(shù)到65即可。用土法測，手緊握料，在手指間有水珠滲出稍滴水為宜。
二、裝瓶
將拌好的料悶堆1～2小時(shí)后裝瓶，用黑白鐵制作能坐在葡萄糖注射液瓶子上的漏斗，將拌完的料用自制的6分盤圓鉤將拌完的料裝入瓶中。再用1厘米的木棍從瓶口中央到瓶底打個(gè)孔。再準(zhǔn)備一盆清水將裝好的葡萄糖注射液瓶子用手以45℃的角度把瓶口放入水盆中轉(zhuǎn)一圈，這樣就把瓶口沾的料涮干凈了，再塞好棉塞。在生產(chǎn)過程中當(dāng)天拌好的料必須當(dāng)天裝瓶當(dāng)天滅菌。
三、滅菌
將裝好的葡萄糖注射液瓶子放在常壓或高壓滅菌鍋里滅菌，在15千克/平方厘米的壓力下保持1.5～2小時(shí)，等壓力降至零時(shí)，將鍋蓋打開三分之一，用鍋內(nèi)余熱將瓶口及棉塞烘干，30分鐘后將葡萄糖注射液瓶子趁熱取出，立即放在接種箱內(nèi)。若用常壓滅菌灶滅菌，保持6～8小時(shí)，將鍋蓋打開1/2，用鍋內(nèi)余熱將瓶口及棉塞烘干。20分鐘后將葡萄糖注射液瓶子趁熱取出，滅菌一定要徹底。
四、接種
黑木耳在接菌時(shí)一定要按無菌操作進(jìn)行，提高成品率，滅菌后出鍋降溫至30℃以下的瓶可以接種，最佳接菌溫度為25～30℃之間。目前，黑木耳的接菌方法很多，可根據(jù)自已具體情況和條件定，要注意，連續(xù)接種時(shí)間不要太長，以免箱內(nèi)溫度過高;一個(gè)試管一級菌種接葡萄糖注射液瓶10瓶，先將試管一級菌種在無菌臺(tái)式酒精燈前拔下棉塞，再將試管里的一級菌種分成10等份，把每份移接到滅菌的葡萄糖注射液瓶子里，一定注意一級菌種不能貼在瓶壁上，立即塞上棉塞縮短接種時(shí)間不給雜菌侵入的機(jī)會(huì)。
五、養(yǎng)菌
在黑木耳菌絲培養(yǎng)全過程中，要?jiǎng)?chuàng)造使菌絲體健壯生長，又能控制黑木耳的子實(shí)體正常發(fā)育的條件，其中溫度是最重要的因素。培養(yǎng)室的第一周溫度為18℃～25℃。最適溫度為18～23℃之間。培養(yǎng)室的溫度不宜超過25℃。培養(yǎng)室的空氣相對濕度為50%～70%，濕度過高，易生雜菌。光線能誘導(dǎo)菌絲體扭結(jié)形成原基。為了控制培養(yǎng)菌絲階段不形成子實(shí)體原基，培養(yǎng)室應(yīng)保持黑暗或極弱的光照強(qiáng)度。培養(yǎng)室內(nèi)四周撒一些生石灰，使之呈石破天驚生環(huán)境，減少霉菌繁殖的機(jī)會(huì)。瓶堆積在地面上培養(yǎng)菌絲時(shí)，要經(jīng)常翻動(dòng)。調(diào)換瓶子的位置，在檢查雜菌時(shí)，一定要輕拿輕放，發(fā)現(xiàn)雜菌應(yīng)及時(shí)取出，另放在溫度較低的地方繼續(xù)觀察。30天基本就長好了，35天就可以接種栽培袋了。
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