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學(xué)院最早可溯源至1922年南京高等師范專科學(xué)校（國立中央大學(xué)前身）農(nóng)業(yè)專修科農(nóng)藝系土壤門（專業(yè)）。1952年，南京大學(xué)（原國立中央大學(xué)）農(nóng)學(xué)院農(nóng)業(yè)化學(xué)系、金陵大學(xué)農(nóng)學(xué)院土壤組和浙江大學(xué)農(nóng)學(xué)院農(nóng)業(yè)化學(xué)系的一部分合并成立南京農(nóng)學(xué)院土壤農(nóng)業(yè)化學(xué)系，1996年更名為資源與環(huán)境科學(xué)學(xué)院，是我國最早具有碩士、博士學(xué)位授予權(quán)的單位之一。學(xué)院以悠久的歷史、雄厚的師資力量、豐碩的教學(xué)科研成果以及良好的社會服務(wù)在國內(nèi)外享有盛譽。一批國內(nèi)外著名的學(xué)者如中國工程院院士蔡道基和中國科學(xué)院院士侯光炯、朱顯漠、王德寶、章申等都曾在本院學(xué)習(xí)或工作過，數(shù)十人成為歐美著名高校、研究所中的杰出學(xué)者,另有一批畢業(yè)生獲得國家千人計劃專家、國家杰青、教育部長江學(xué)者、“全國中青年科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才”、全國農(nóng)業(yè)科研杰出人才等榮譽稱號。畢業(yè)生中也產(chǎn)生了一些省部級、廳局級、校（所）長等優(yōu)秀管理者。

       全院現(xiàn)有教職工147人，其中教授、研究員和正高級實驗師43人，副教授、副研究員、高級實驗師41人。擁有“國家千人計劃專家”、“國家杰出青年基金獲得者”、“國家教學(xué)名師”、“全國農(nóng)業(yè)科研杰出人才”、“全國中青年科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才”、“全國師德標(biāo)兵”、國務(wù)院學(xué)位委員會學(xué)科（農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境）評議組召集人、國家973項目首席科學(xué)家等。有入選國家“千人計劃”青年人才、優(yōu)青、教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才、江蘇省特聘教授、江蘇省“333高層次人才工程”學(xué)術(shù)領(lǐng)軍人才、江蘇省杰出青年基金獲得者、江蘇省“青藍工程”人才。有10多位教授任職國際學(xué)術(shù)組織、國際學(xué)術(shù)期刊編委、入選Elsevier中國高頻引用作者榜單（農(nóng)業(yè)與生物學(xué)領(lǐng)域）。擁有“教育部科技創(chuàng)新發(fā)展團隊”1個，農(nóng)業(yè)部和江蘇省科研創(chuàng)新團隊4個，“江蘇省高校優(yōu)秀學(xué)科梯隊”1個。

       學(xué)院具有較強的學(xué)科實力，學(xué)科排名處于ESI國際生態(tài)環(huán)境領(lǐng)域前1%之列。學(xué)院設(shè)有農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、生態(tài)學(xué)2個一級學(xué)科博士后流動站、擁有農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境國家一級重點學(xué)科(在2012年全國第三輪一級學(xué)科評估中排名并列第一)、江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科和“985優(yōu)勢學(xué)科創(chuàng)新平臺”，年招收研究生250名（其中博士生50多名）、本科生180名左右。近年來，有3篇博士論文被評為全國百篇優(yōu)秀博士論文，另有2篇被評為全國優(yōu)秀博士論文（提名）。本科專業(yè)中農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境專業(yè)為教育部特色專業(yè)和江蘇省首批A類品牌專業(yè)，環(huán)境工程專業(yè)為省品牌專業(yè)，通過了全國工程教育的專業(yè)認(rèn)證；學(xué)院教學(xué)中心被評為“江蘇省實驗教學(xué)省級示范中心”。擁有《植物營養(yǎng)學(xué)》和《生態(tài)學(xué)》2個“國家級優(yōu)秀教學(xué)團隊”。“高級植物營養(yǎng)學(xué)”被評為教育部來華留學(xué)英語授課品牌課程。學(xué)院獨立設(shè)有黃瑞采教授獎學(xué)金和十多個企業(yè)獎助學(xué)金，年資助在校生近百萬元。

     學(xué)院科研實力雄厚，擁有國家工程中心（科技部），國家重點實驗室（共建），國家地方聯(lián)合工程中心（發(fā)改委）（共建），省部級重點實驗室和工程中心。在固體廢棄物的資源化利用、作物養(yǎng)分資源高效利用和阻控重金屬積累的分子遺傳基礎(chǔ)理論和技術(shù)、有機污染物在土壤-植物系統(tǒng)中的生物學(xué)行為、農(nóng)業(yè)固碳減排與氣候變化應(yīng)對、沿海灘涂等非耕地資源綜合利用等方面引領(lǐng)本學(xué)科領(lǐng)域的發(fā)展；新型微生物有機肥研發(fā)、污泥和污水生物處理工程技術(shù)、綠色食品生產(chǎn)等許多成熟技術(shù)在生產(chǎn)實踐中發(fā)揮了重要作用。近年來作為第一完成單位獲國家技術(shù)發(fā)明獎二等獎1項，國家科技進步獎二等獎1項，國家教學(xué)成果二等獎1項，省部級獎勵10多項。承擔(dān)著一批國家和地方部門的重大科研項目，年到位科研經(jīng)費近6000萬元，年發(fā)表SCI論文150多篇（單篇平均影響因子約3.5），其中有較高的比例入選ESI高頻引用論文。在國際交流方面，有教育部和國家外專局的“農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境學(xué)科生物學(xué)研究”創(chuàng)新引智基地（“111”項目），與美國、英國、德國、加拿大、澳大利亞、日本、香港等國家和地區(qū)的數(shù)十所著名高校和研究所建立了較為緊密的合作關(guān)系。

     學(xué)院建設(shè)目標(biāo)：以地球科學(xué)與生命科學(xué)為交叉融合、以農(nóng)業(yè)資源可持續(xù)利用和生態(tài)環(huán)境保護為特色的國際一流的研究型學(xué)院及知識創(chuàng)新基地和高層次人才培養(yǎng)基地。