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　　云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)與種質(zhì)資源研究所（以下簡稱“生物所”）建于2004年6月，其前身是創(chuàng)建于1986年的云南省遺傳工程研究室（“遺傳室”）、云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院分析測試中心（“測試中心”），以及1988年建立的云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院品種資源站（“品資站”）。1992年，遺傳室與測試中心合并成立云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所，同年，經(jīng)云南省人民政府批準(zhǔn)，依托云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院，在所內(nèi)建設(shè)云南省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點實驗室，1994年建成并通過驗收，是我國地方農(nóng)科院系統(tǒng)最早成立的農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究機(jī)構(gòu)之一。1998年底，經(jīng)云南省人民政府省院省校合作辦公室批準(zhǔn)，與北京大學(xué)植物基因工程與蛋白質(zhì)工程國家重點實驗室合作共建“北京大學(xué)--云南省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)聯(lián)合實驗室”。2002年經(jīng)考核評估，被命名為“農(nóng)業(yè)部南方高原農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點開放實驗室”。2004年，云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院進(jìn)行學(xué)科結(jié)構(gòu)調(diào)整，生物技術(shù)所與品資站合并成立云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)與種質(zhì)資源研究所。
　　研究所和重點實驗室不斷凝煉優(yōu)化學(xué)科方向，目前主要有作物種質(zhì)資源、農(nóng)作物生物技術(shù)育種、應(yīng)用植物病毒三大學(xué)科方向，建設(shè)農(nóng)業(yè)生物資源與農(nóng)業(yè)生物技術(shù)兩大平臺，是我國南方高原地區(qū)特色農(nóng)業(yè)生物資源的生物技術(shù)研究、開發(fā)、國內(nèi)外合作交流及人才培養(yǎng)基地。建有國家人事部博士后科研工作站，與云南大學(xué)等單位合作的國家生命科學(xué)和技術(shù)人才培養(yǎng)基地，共建云南大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)博士點和碩士點。與云南大學(xué)植物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、微生物學(xué)、生物工程專業(yè)，云南農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳育種專業(yè)，昆明理工大學(xué)生物工程學(xué)院微生物、植物學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)專業(yè)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究生院、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、大理學(xué)院等聯(lián)合招收碩士研究生，與中國科學(xué)院昆明植物所聯(lián)合培養(yǎng)博士及碩士研究生。與美國內(nèi)華達(dá)州立大學(xué)Jeff Shen實驗室合作共建聯(lián)合實驗室，與明技科技有限公司共建美國Backman Culter公司基因測序聯(lián)合實驗室，與美國阿拉斯加大學(xué)、康奈爾大學(xué)、德州農(nóng)工大學(xué)，意大利國際植物遺傳資源研究所，法國國際農(nóng)業(yè)研究中心（CIQAD），法國聯(lián)邦作物科學(xué)中心，韓國農(nóng)村振興廳（RDA），越南國家農(nóng)業(yè)科學(xué)院等機(jī)構(gòu)開展了合作研究項目。